Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GABPB1Q06547 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms