Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP2Q05952 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms