Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms