Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPN12Q05209 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPN12Q05209 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms