Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UBXN1Q04323 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms