Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 LYRM4-207ENST00000480566 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AL133330.1-201ENST00000510619 704 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 NOVA1-AS1-201ENST00000547786 818 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC114781.2-201ENST00000515670 394 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNB1Q02641 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms