Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POU5F1Q01860 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms