Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMF1P82094 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMF1P82094 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMF1P82094 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMF1P82094 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMF1P82094 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms