Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB15P59190 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB15P59190 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB15P59190 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB15P59190 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB15P59190 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB15P59190 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB15P59190 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB15P59190 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB15P59190 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB15P59190 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB15P59190 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB15P59190 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB15P59190 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB15P59190 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB15P59190 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB15P59190 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB15P59190 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB15P59190 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms