Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EEFSECP57772 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms