Protein–RNA interactions for Protein: P57073

SOX8, Transcription factor SOX-8, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX8P57073 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX8P57073 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX8P57073 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX8P57073 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX8P57073 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX8P57073 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX8P57073 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX8P57073 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX8P57073 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX8P57073 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms