Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRPF1P55201 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms