Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTPAP49638 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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