Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FNTAP49354 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FNTAP49354 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNTAP49354 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNTAP49354 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms