Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRPC1P48995 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms