Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CAPZBP47756 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms