Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRXP46100 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRXP46100 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATRXP46100 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms