Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFSF9P41273 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms