Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FDFT1P37268 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FDFT1P37268 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms