Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LTBRP36941 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LTBRP36941 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms