Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD12P35452 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD12P35452 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms