Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA13P31271 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms