Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTX3P26022 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTX3P26022 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTX3P26022 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms