Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTSSP25774 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSSP25774 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSSP25774 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSSP25774 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms