Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNCP24821 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNCP24821 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNCP24821 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNCP24821 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNCP24821 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNCP24821 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNCP24821 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNCP24821 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNCP24821 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNCP24821 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms