Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXA5P20719 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA5P20719 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA5P20719 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA5P20719 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA5P20719 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA5P20719 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA5P20719 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA5P20719 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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HOXA5P20719 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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HOXA5P20719 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXA5P20719 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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