Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EGR1P18146 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EGR1P18146 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EGR1P18146 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EGR1P18146 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EGR1P18146 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EGR1P18146 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EGR1P18146 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms