Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTPS1P17812 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms