Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRKCAP17252 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms