Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NME1P15531 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NME1P15531 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NME1P15531 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NME1P15531 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms