Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRFP10586 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRFP10586 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRFP10586 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRFP10586 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRFP10586 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRFP10586 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRFP10586 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRFP10586 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms