Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RGPD1P0DJD0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD1P0DJD0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms