Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4BP0C0L5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms