Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB3P05106 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms