Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZBED1O96006 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms