Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SEC24DO94855 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SEC24DO94855 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SEC24DO94855 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SEC24DO94855 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SEC24DO94855 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEC24DO94855 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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