Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CACNA1GO43497 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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