Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OIP5O43482 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OIP5O43482 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OIP5O43482 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OIP5O43482 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OIP5O43482 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OIP5O43482 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OIP5O43482 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OIP5O43482 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OIP5O43482 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OIP5O43482 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OIP5O43482 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OIP5O43482 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OIP5O43482 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OIP5O43482 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OIP5O43482 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OIP5O43482 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OIP5O43482 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OIP5O43482 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OIP5O43482 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms