Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA5O15230 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms