Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CEP290O15078 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CEP290O15078 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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CEP290O15078 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP290O15078 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP290O15078 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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