Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNMO15061 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNMO15061 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNMO15061 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYNMO15061 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms