Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM6BO15054 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM6BO15054 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms