Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PHOX2AO14813 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms