Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRTO14522 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
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