Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKBIEO00221 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms