Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H7C417 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H7C417 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H7C417 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H7C417 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H7C417 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H7C417 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H7C417 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H7C417 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H7C417 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H7C417 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H7C417 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H7C417 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms