Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B4DXG7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DXG7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DXG7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms