Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA6L4A6NEF3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA6L4A6NEF3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms