Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms