Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PAXBP1Q9Y5B6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAXBP1Q9Y5B6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms